L'activité historique du CIMPA est l'organisation d'Écoles CIMPA dans les pays en développement, elle se concentre sur les zones dans lesquelles il y a une volonté forte de développer les mathématiques et où un projet de recherche est viable. Chaque École CIMPA a pour but de proposer une introduction à un sujet de recherche actif en mathématiques, que ce soit en mathématiques pures et appliquées ou dans un domaine connexe tel que l'informatique ou la physique théorique. Les Écoles CIMPA s'adressent en premier lieu aux étudiants et enseignants-chercheurs des pays en développement, elles bénéficient d'ailleurs d'un soutien financier du CIMPA visant spécifiquement à couvrir les frais de participations de ce type de participants. Des appels à projets sont lancés chaque année pour aboutir à l'organisation d'une vingtaine d'écoles par an.
Jusqu'à aujourd'hui le CIMPA a organisé 428 Écoles dans 73 pays listés ci-dessous (sont précisés entre parenthèses pour chaque pays le nombre d'écoles et l'année des écoles) :
Afrique du Sud (10 école en 2007, 2011, 2013, 2015, 2018, 2020, 2022, 2023)
Albanie (2 école en 1993, 2022)
Algérie (7 école en 2003, 2005, 2008, 2014, 2016, 2019, 2021)
Arabie Saoudite (1 école en 2012)
Argentine (20 école en 1996, 2000, 2003, 2006, 2008, 2010-2013, 2015-2019, 2023)
Arménie (1 école en 2008)
Bangladesh (2 école en 2019, 2022)
Bénin (6 école en 1997, 2012, 2014, 2018, 2022)
Brésil (13 école en 1993, 1999, 2001, 2003, 2013, 2015, 2017, 2019, 2021-2023)
Burkina Faso (4 école en 1998, 2009, 2012, 2021)
Burundi (1 école en 2021)
Cameroun (6 écoles en 1999, 2007, 2009, 2011, 2016, 2018)
Chili (12 école en 1991, 1994, 1996, 1999, 2001, 2004, 2010, 2014-2016, 2019)
Chine (14 écoles en 1991, 1993, 1994, 1996-2002, 2004, 2006, 2010)
Colombie (16 école en 1999, 2001, 2003, 2007, 2011-2014, 2016, 2018, 2019, 2022, 2023)
Congo-Brazzaville (1 école en 2022)
Corée du Sud (2 écoles en 2015, 2018)
Côte d'Ivoire (3 écoles en 2014, 2016, 2017)
Cuba (8 école en 2000, 2006, 2013, 2016, 2017, 2019, 2023)
Équateur (1 école en 2017)
Égypte (5 école en 1989, 1999, 2007, 2009, 2022)
Espagne (3 écoles en 1996, 2006)
Éthiopie (1 école en 2021)
France (54 écoles en 1979-1996, 1999, 2009)
Gabon (1 école en 2023)
Hongrie (1 école en 2002)
Inde (19 schools in 1995, 2002, 2003, 2005, 2008, 2013-2017, 2019, 2022, 2023)
Ile Maurice (1 école en 2016)
Indonésie (5 école en 2009, 2011, 2014, 2020)
Iran (9 école en 2005, 2006, 2008, 2009, 2015, 2019, 2021)
Irak (1 école en 2014)
Jamaïque (1 école en 2017)
Jordanie (1 école en 2005)
Kenya (1 école en 2015)
Laos (3 écoles en 2012, 2014, 2017)
Liban (9 école en 2004, 2007, 2010, 2012, 2014, 2017, 2018, 2022, 2023)
Madagascar (6 école en 2008, 2016, 2019, 2021, 2022)
Mauritanie (4 écoles en 1998, 2005, 2016)
Malaisie (1 école en 2006)
Malawi (1 école en 2023)
Mali (1 école en 2010)
Maroc (28 école en 1999, 2000, 2002, 2004, 2007-2009, 2012-2021, 2023)
Mexique (14 école en 2003, 2006, 2012-2014, 2016, 2018, 2021, 2022, 2023)
Mongolie (5 école en 2013, 2015, 2017, 2021)
Namibie (1 école en 2023)
Népal (5 école en 2010, 2014, 2018, 2019, 2023)
Niger (1 école en 2002)
Nigeria (4 écoles en 1985, 1987, 2013, 2017)
Ouzbékistan (2 écoles en 2018 et 2021)
Pakistan (9 école en 2007-2009, 2012, 2014, 2018, 2021, 2022)
Palestine (1 école en 2014)
Panama (1 école en 2015)
Pérou (7 écoles en 2004, 2006, 2008, 2010, 2015, 2017)
Philippines (9 école en 2000, 2005, 2007, 2009, 2013, 2014, 2020, 2022, 2023)
République Démocratique du Congo (2 écoles en 2011, 2018)
Roumanie (2 écoles en 2003, 2005)
Russie (1 école en 2017)
Rwanda (1 école en 2021)
Salvador (1 école en 2022)
Sénégal (13 école en 2001, 2010-2017, 2021, 2022)
Sri Lanka (1 école 2004)
Syrie (1 école en 2004)
Taïwan (1 école en 2004)
Tchad (1 école en 2023)
Thaïlande (2 écoles en 2011, 2013)
Togo (2 écoles en 2018, 2021)
Tunisie (17 écoles en 1986, 1995, 1996, 2004, 2005, 2009, 2011-2013, 2015, 2016, 2018, 2019, 2022)
Turquie (10 écoles en 2005, 2007, 2008, 2010, 2014, 2015, 2017, 2022, 2023)
Ukraine (1 école en 2011)
Uruguay (8 écoles en 1995, 2003, 2007, 2010, 2012, 2015, 2016, 2019)
Venezuela (3 écoles en 2002, 2006, 2012)
Vietnam (13 écoles en 1997, 1998, 2001, 2006, 2007, 2010, 2011, 2013, 2016-2019, 2021)